Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP11369 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PolP11369 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PolP11369 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PolP11369 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PolP11369 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PolP11369 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PolP11369 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PolP11369 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PolP11369 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PolP11369 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PolP11369 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP11369 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP11369 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PolP11369 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PolP11369 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PolP11369 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PolP11369 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PolP11369 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PolP11369 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PolP11369 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PolP11369 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PolP11369 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PolP11369 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms