Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Myod1P10085 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Myod1P10085 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms