Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CatspereP0DP43 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms