Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pla2g4bP0C871 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pla2g4bP0C871 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms