Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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TtrP07309 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TtrP07309 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TtrP07309 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtrP07309 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtrP07309 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtrP07309 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtrP07309 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtrP07309 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtrP07309 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtrP07309 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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TtrP07309 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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TtrP07309 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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TtrP07309 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtrP07309 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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TtrP07309 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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TtrP07309 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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