Protein–RNA interactions for Protein: P06876

Myb, Transcriptional activator Myb, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MybP06876 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MybP06876 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MybP06876 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MybP06876 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MybP06876 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MybP06876 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MybP06876 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MybP06876 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MybP06876 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MybP06876 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MybP06876 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MybP06876 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MybP06876 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MybP06876 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MybP06876 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MybP06876 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MybP06876 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MybP06876 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MybP06876 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MybP06876 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MybP06876 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MybP06876 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms