Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa4P06798 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms