Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms