Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06321 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06321 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P06321 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P06321 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06321 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06321 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06321 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06321 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06321 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06321 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06321 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06321 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06321 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06321 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06321 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06321 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06321 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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