Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04212 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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