Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HbaP01942 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HbaP01942 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HbaP01942 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HbaP01942 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HbaP01942 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HbaP01942 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HbaP01942 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HbaP01942 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HbaP01942 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HbaP01942 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HbaP01942 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HbaP01942 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HbaP01942 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HbaP01942 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HbaP01942 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HbaP01942 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms