Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Ab1P01921 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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