Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01747 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01747 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms