Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01678 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01678 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01678 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01678 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01678 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01678 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01678 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01678 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01678 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01678 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms