Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01672 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01672 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01672 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01672 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01672 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01672 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01672 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01672 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01672 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01672 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms