Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01665 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01665 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
P01665 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01665 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01665 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms