Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01664 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01664 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01664 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01664 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01664 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01664 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01664 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01664 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01664 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01664 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01664 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01664 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01664 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01664 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01664 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01664 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
P01664 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01664 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms