Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01649 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01649 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01649 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms