Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms