Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd160O88875 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd160O88875 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Cd160O88875 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms