Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShdO88834 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ShdO88834 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShdO88834 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms