Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1O88746 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tom1O88746 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1O88746 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1O88746 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1O88746 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1O88746 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1O88746 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tom1O88746 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1O88746 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1O88746 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1O88746 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1O88746 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1O88746 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1O88746 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1O88746 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1O88746 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1O88746 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1O88746 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1O88746 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1O88746 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1O88746 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1O88746 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1O88746 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1O88746 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1O88746 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tom1O88746 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1O88746 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1O88746 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1O88746 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1O88746 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1O88746 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1O88746 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1O88746 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tom1O88746 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1O88746 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tom1O88746 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1O88746 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1O88746 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1O88746 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1O88746 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tom1O88746 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tom1O88746 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tom1O88746 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms