Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BlmO88700 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BlmO88700 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BlmO88700 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BlmO88700 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BlmO88700 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BlmO88700 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BlmO88700 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BlmO88700 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BlmO88700 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BlmO88700 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BlmO88700 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BlmO88700 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BlmO88700 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BlmO88700 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BlmO88700 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BlmO88700 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms