Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp2O88623 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms