Protein–RNA interactions for Protein: O88413

Tulp3, Tubby-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp3O88413 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tulp3O88413 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tulp3O88413 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tulp3O88413 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tulp3O88413 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tulp3O88413 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tulp3O88413 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tulp3O88413 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tulp3O88413 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tulp3O88413 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tulp3O88413 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tulp3O88413 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tulp3O88413 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tulp3O88413 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tulp3O88413 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tulp3O88413 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tulp3O88413 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tulp3O88413 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tulp3O88413 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tulp3O88413 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tulp3O88413 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tulp3O88413 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tulp3O88413 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tulp3O88413 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tulp3O88413 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tulp3O88413 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tulp3O88413 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tulp3O88413 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tulp3O88413 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tulp3O88413 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tulp3O88413 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms