Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AvilO88398 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AvilO88398 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AvilO88398 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AvilO88398 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AvilO88398 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AvilO88398 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AvilO88398 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AvilO88398 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AvilO88398 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AvilO88398 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms