Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtssO70370 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtssO70370 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtssO70370 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms