Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxq1O70220 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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