Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Supt5hO55201 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms