Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms