Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eif6O55135 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eif6O55135 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif6O55135 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif6O55135 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms