Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap2O55126 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms