Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms