Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SlkO54988 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlkO54988 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlkO54988 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlkO54988 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlkO54988 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlkO54988 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlkO54988 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlkO54988 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlkO54988 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlkO54988 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SlkO54988 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SlkO54988 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SlkO54988 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SlkO54988 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SlkO54988 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlkO54988 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms