Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole2O54956 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms