Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb6O54946 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms