Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms