Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms