Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccr6O54689 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccr6O54689 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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