Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms