Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb10O35955 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb10O35955 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb10O35955 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb10O35955 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb10O35955 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb10O35955 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb10O35955 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb10O35955 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb10O35955 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb10O35955 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb10O35955 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb10O35955 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb10O35955 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb10O35955 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb10O35955 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms