Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms