Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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