Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms