Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms