Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold2O35654 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pold2O35654 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pold2O35654 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pold2O35654 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms