Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RaxO35602 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RaxO35602 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RaxO35602 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RaxO35602 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RaxO35602 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RaxO35602 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RaxO35602 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms