Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk4O35493 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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