Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms