Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms